Jeśli ktoś nadal ma problem to przesyłam rozwiązanie, które u mnie zadziałało:
1. W lupie w menu start proszę wpisać edytor rejestru i wybrać opcję uruchom jako administrator
2. Rozwinąć odpowiednie foldery zgodnie z : HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Cryptography\Calais\Cache
3. Następnie proszę o usunięcie klucza (wpisu) cache (proszę tylko nie usuwać tego folderu po lewej stronie).
4. Proszę zrestartować komputer, podłączyć kartę i sprawdzić czy podpis działa w aplikacji.